为未来的农业、生物技术和生物医学发展保护植物资源至关重要。以色列拥有一些最重要的全球遗传资源，以及最先进的农业、遗传和生物技术研究中心，因此必须保存其遗传资产，以确保自己以及世界的经济和科学未来。

以色列植物基因库促进建立和维护基因库的研究，在基因库的运作、种子的保存和遗传变异等方面和国内、国际进行合作。

以色列植物基因库负责收集和保护以色列所有植物的野生种子，重点是可能具有未来农业经济或社会文化潜力的野生植物。 近年来，基因库已将其活动扩展到包括稀有野生，特有或濒危植物（以色列国家生物多样性计划，2010年）。 基因库旨在建立一个在以色列植物区系中发现的重要植物性状的遗传数据库。 它还专门用于保护地方品种，这些地方品种是古代农作物的祖先，其中包含随着时间推移而发展的特征（基因）的进化记录。

植物基因库包含用于种子保存和处理的独特设施，用于按重量分离种子的设备，可控制温度和湿度的干燥室，用于冷冻的储藏室，实验室，种子收集和处理系统（质量测试，发芽）以及繁殖系统。 基因库的所有活动（数据收集，照片地理信息，清洁数据，包装，发芽，田间生长，种子订单和分发）都记录在MySQL服务器数据库中，该数据库管理和计划目标设置并监视正在进行的操作。该数据库导入到植物基因库的网站，为不同的受众提供数据和订购种子样本。

建立了以色列植物物种的国家级收藏，以种子的形式保存，最大程度展现每个物种的遗传多样性。 在精确的条件下收集、处理和储存种子，以确保其长期生存的能力。基因库的研究基础设施向所有公共和私人研究机构开放，并且是唯一保留以色列所有野生植物的生物和遗传多样性的机构。

基因库设施还在中长期内维护ARO的种植物收集和ARO研究人员的种子收集。基因库和ARO收集了大约2070个不同物种的30,000个样本。这些样品中约有15,000个是在以色列收集的，主要来自野生种群。

此外，还有来自152个国家的大量品种和商业品种。 收集的样品包括ARO引进部门收集的样品，该部门先于植物基因库成立，其职责是识别和调查具有经济农业价值以适应以色列商业化种植的不同品种。

作为国家生态保护工作的一部分，植物基因库与许多负责保护国家生物多样性和自然宝藏的国家机构建立了长期合作伙伴关系。

2007年，植物基因库开始与以色列公园和自然管理局（IPNA）合作，旨在保护稀有和濒危植物野生种群中代表性的遗传多样性样本。该项目收集、处理和保护稀有物种的种子，以确保其长期的生存能力。植物基因库还收集和繁殖种子以进行长期保存。 最近，植物基因库和IPNA扩大了合作伙伴关系，以传播濒危植物物种，并将其重新引入其自然栖息地。

自2009年以来，以色列环境保护部一直支持植物基因库计划，以保护受损地区的植物遗传多样性。重点是人类活动和发展密集的地区，例如城市扩张和发展，道路建设，农业发展和周边地区，处于危险中的沿海和 kurkar（沿海砂岩）山脊，包括仅在这些生态位中发现的具有独特生态型的湿地。

植物基因库已与不同国家的植物基因库以及专注于生物多样性研究和保护的国际机构建立并持续发展合作关系，例如国际生物多样性组织和欧洲作物遗传资源合作计划（ECPGR：European Cooperative Programme for Crop Genetic Resources），这是一项致力于作物遗传资源的欧洲计划。

植物基因库与Kew皇家植物园的千年种子库（MSB：Millennium Seed Bank）有合作协议。 以色列植物基因库向MSB提供种子样品和压制的植物标本，以备后用。种子共享基于法律协议和合作伙伴关系。 2013年，MSB签署了一项共同资助协议，以收集全球主要粮食作物的野生亲缘种。2016年，签署了一项协议，共同为C4项目的植物收集提供资金。